Le SNUEP-FSU par l’intermédiaire de la FSU siège dans les différentes instances académiques :
le Comité Technique Académique : CTA
le Comité Académique de l’Éducation Nationale : CAEN
le Comité Régional de l’Emploi, de la Formation et de l’Orientation professionnelles : CREFOP
la Commission Académique d’Action Sociale ( CAAS)
la Conseil de l’Education Nationale ( CEN)